Служение
Забайкальская Духовная Миссия, Бырцанский миссионерский стан 
иерей 
Должность миссионер 
Год начала 1903 
Месяц начала 7 
Год окончания 1903 
В июле 1903 года о.Епифаний был направлен для служения в Бырцанский миссионерский
стан, входя в состав Забайкальской Духовной Миссии
Забайкальская Духовная Миссия, Чита 
иерей 
Должность помощник начальника (с 11.1903г.), начальник (с 20.05.1905г.) Духовной Миссии 
Год начала 1904 
Год окончания 1907 
Почти сразу был отозван в Читу в связи с назначением председателем совета
Читинского центрального миссионерского училища.
В ноябре 1903 г., после учреждения должности помощника начальника Забайкальской
Духовной Миссии (главой Миссии тогда являлся правящий Забайкальский архиерей),
был назначен на эту должность.
После выхода указа от 17 апреля 1905г. об укреплении начал веротерпимости
в Забайкалье возникла опасность отпадения от Православия части крещеных бурят.
О.Епифанию выпала задача организации борьбы с вероотступничеством и ограждение
крещеных инородцев Забайкалья от поглощения их снова ламаизмом после
закона 17 апреля 1905 года.
С этим делом архимандрит Ефрем справлялся успешно и умело, активно
противодействуя попыткам ламаистского духовенства побудить крещеных ранее
местных жителей отказаться от христианства.
О.Епифанию, как руководителю Духовной Миссии, удалось терпеливой проповеднической
работой удержать колеблющихся бурят от вероотступничества.
На основе своего опыта он писал и регулярно публиковал в Чите и Москве статьи
о миссионерской деятельности в Забайкалье.
Он был редактором и одним из авторов "Забайкальских епархиальных ведомостей".
Статьи о религиозном и культурном быте бурятов, написанные им в эти годы
показывают проницательность и стойкость в миссионерском делании.
Как инспектор Учительских курсов при Читинском миссионерском училище, он
руководил сбором средств на строительство нового здания училища (заложено
16 мая 1907г.).
В это же время он работал в штате Забайкальского епархиального училищного совета,
был председателем экзаменационной комиссии для испытания лиц, ищущих
священства, диаконского сана и псаломщических мест.
Он исполнял также должность председателя Совета женского епархиального
училища.
Состоял членом-казначеем Братства во имя св. равноапостольных Кирилла и Мефодия