Новомученики, исповедники, за Христа пострадавшие в годы гонений на Русскую Православную Церковь в XX в. (с) ПСТГУ, ПСТБИ (с) Братство во Имя Всемилостивого Спаса
Осуждения Особое Совещание (тройка?) при НКВД СССР 03/09/1936 Обвинение"соучастник к/р деятельности Толстопятова, член к/р группы монахов и а/c хищнической группы священников-тихоновцев Никольской церкви, систематическая антисоветская агитация" Статьяст.58–10,58–11 УК РСФСР Приговор5 лет ИТЛ Групповое дело"дело епископа Александра (Толстопятова) и священника о.Иоанна Мальникова, Алма-Ата, 1936г."
Свидетелем по делу проходила его сестра Мельникова Мария Афанасьевна.
Неизвестно место отбывания наказания и сроки, но известно, что о.Иоанн Мельников был
участником Великой Отечественной войны