30.08.1911 хиротонисан во епископа Новгород-Северского, викария Черниговской епархии; с 1916 г. епископ Стародубский, викарий Черниговской епархии; с 1917 г. епископ Черниговский и Нежинский. Член Всероссийского Поместного Собора 1917- 1918 гг. В августе 1922 г. вошел в состав Св. Синода епископов Украины. В октябре 1922 г. арестован и осужден к высылке за пределы Черниговской епархии на три года; в ноябре 1923 г. возведен в сан архиепископа; в 1925 г. проживал в Москве без права выезда. С конца 1925 г. в заключении и ссылке. Умер в заключении в г. Котельничи Кировской обл. С проповедью о Христе святитель обошел всю Украину, за что получил в народе ласковое прозвание "наш апостол". По его молитвам Господь исцелял людей от душевных и телесных недугов. И сегодня, по свидетельствам очевидцев люди, посещающие могилу святителя, получают по его молитвам от Господа утешения и исцеления. Канонизирован 20.08.2000г. РПЦЗ. День памяти 28 мая.
           В Вестнике ПСТГУ за 2009г. вып. II:1 (30). (с.82) были опубликованы новые данные к биографии архиепископа Пахомия со ссылкой на архивный документ (ЦГАООУ. Ф.263. Оп.1. Д. 45504. Л. 30.). "Ранее было известно, что в октябре 1922 г. он был арестован и осужден к высылке за пределы Черниговской епархии. Через несколько месяцев он появился в Москве. Теперь же становится известным, что в начале 1923 г. архиепископ Пахомий некоторое время проживал в Предмостной Слободке, находящейся на Левом берегу Днепра, напротив Киева (сейчас это место вошло в состав Киева). Предмостная Слободка находилась на самой границе между Киевской и Черниговской епархиями."